1. Elektroninė kūno temperatūra turi didelį jautrumą, todėl matavimo metu ji yra jautresnė kitų veiksnių trikdžiams. Pavyzdžiui, padėties padėtis, ar pažastis yra sausa matuojant pažasties temperatūrą ir kt.
2. Neteisingas temperatūros matavimo metodas gali lengvai sukelti didelių matavimo klaidų.